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2013年《深圳市公共白皮书》发布,明确要求建立深圳新一代双偏振天气雷达。为落实《深圳市公共白皮书》任务,在深圳市委市政府和相关部门大力支持下,深圳市气象局于2014年初开始启动项目选址、规划、设计、论证等工作,在历经雷达站选址、建设用地申请、雷达站设计、雷达频率申请、电磁环境测试、航空净空限高测试、雷达站迁站申请、探测环境申报等一系列前期工作后,2016年11月16日市委市政府、中国气象局、广东省气象局主要领导共同宣布深圳新一代双偏振天气雷达项目正式开工建设。目前项目基建部分正由深圳市建筑工务署组织管理实施,建设工期为两年,基建部分在进行 的收尾工作;雷达设备正由中国气象局北京敏视达雷达有限公司生产、安装、调试,在3月7日投入正式运行。
深圳新一代双偏振天气雷达项目设计概念为一轮月,三片云,其中三个开阔的景观平台,远处看去仿佛漂浮在山间的三片云,雷达塔及必要建筑元素造型宛如悬在林梢的一轮明月。在建设过程中,我们始终坚持共建、共享、共用的原则,在宝安区政府、宝安广电集团、深圳机场等单位的大力支持和配合下,雷达站的交通、供电、供水、通信以及数据共享等方面的建设工作顺利开展,有力保障了项目进度和质量。
在以往的研究中,环形RNA的识别方法主要是利用环形RNA特有结构——反向剪接序列特征进行识别。然而,由于二代测序的读长普遍较短,研究者们虽然可以获得大量的反向剪接位点,却无法高通量获得环形RNA的完整内部结构信息,也无法对不同可变剪接产物进行定量。为了解决该问题,赵方庆团队首先提出了一个新的环形RNA识别特征——反向重叠区(Reverse overlap)。该特征通常出现在读长较长的环形RNA测序中。与以往的所有识别算法不同,该特征不仅可以用于判断转录本双端测序中的一对测序序列是否来自于环形RNA,也可以用于判断该序列是否可以覆盖整个环形RNA。研究人员利用该方法从不同哺乳动物的脑组织中获得超过80%的环形RNA的全长序列。
环形RNA的全长重建是对其定量的基础。对于拥有多种可变剪接产物的环形RNA,CIRI-full采用蒙特卡罗法模拟来自不同剪切产物的读段在全长序列上的分布,通过梯度下降法,筛选出与优表达量组合。其中,每个外显子上的测序覆盖度及可变剪接事件都可用于判断预测结果与真实情况的差异。研究人员使用模拟和真实数据验证了这种方法的准确性。对于每个BSJ位点产生多个可变剪接产物的表达数据,CIRI-full不仅可以灵敏地重构其全长序列,并且可以地预测其相对丰度。该研究为环形RNA组成和功能研究提供了新视角,呈现了环形转录本更加细致的内部结构,并实现了转录本水平的定量,为后续筛选有潜在功能的环形RNA分子提供了重要方法学工具。
该工作主要由赵方庆课题组的博士研究生郑毅和助理研究员冀培丰完成,并获得自然科学基金委、科技部重点研发计划及中科院的经费支持。
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